MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS4

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019437	ACA	2	6	1435	1440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019437	CAA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019437	AGA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019437	GCATT	2	10	1549	1558	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019437	AAATTA	2	12	1588	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019437	GGT	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019437	A	7	7	1616	1622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019437	T	6	6	1627	1632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019437	A	7	7	2032	2038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019437	AATT	2	8	2068	2075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019437	TCAC	2	8	2132	2139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019437	G	6	6	2231	2236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019437	T	9	9	2237	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019437	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019437	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019437	GTTCCA	2	12	4055	4066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019437	TTGG	2	8	4116	4123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019437	ATC	2	6	4128	4133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019437	GTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019437	AGT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019437	T	6	6	4456	4461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019437	T	6	6	4485	4490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019437	TCAAT	2	10	4537	4546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019437	ATTAT	2	10	4566	4575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019437	GAC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019437	ATTG	2	8	4645	4652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019437	CACG	2	8	4674	4681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019437	AAT	2	6	4694	4699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019437	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019437	TCAT	2	8	4718	4725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019437	TAT	2	6	4762	4767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019437	T	6	6	5763	5768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019437	ATA	2	6	5796	5801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019437	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019437	T	6	6	5901	5906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019437	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019437	T	6	6	6018	6023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019437	ATT	2	6	6110	6115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019437	AAAG	2	8	6145	6152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019437	TGA	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019437	TGCT	2	8	6174	6181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019437	TATT	2	8	6277	6284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019437	A	6	6	6289	6294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019437	AAG	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019437	TTA	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019437	AT	4	8	6382	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019437	TTA	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019437	AACT	2	8	6473	6480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019437	AAG	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019437	T	6	6	6773	6778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019437	TAGA	2	8	6940	6947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019437	TAGA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019437	GTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019437	TA	3	6	7004	7009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.